在人们还没有察觉到的时候,未知的病毒——漏洞体,已经在社会上蔓延开来。政府在圣都大学附属医院秘密设立了电脑急救中心(CR),以应对病毒蔓延的情况,避免人类走向灭亡。在数字游戏的世界中,打败游戏病毒漏洞体!使用与游戏企业共同研发出的玩家驱动器与卡带,候选人医生就能变身为假面骑士!年轻的实习医生宝生永梦背负的命运,就是变身为假面骑士艾克赛德,保护患者不受漏洞体侵害。
心医叶平安(刘诗诗 饰)为一桩旧案寻至圣都,因擅用心计,被人视作“巫女”,人人避之不及。大理寺丞元少城(窦骁 饰)出身邙沟贱民区,他冷峻狠戾,时刻抓住机会向上爬。此时,圣都突发命案,一朝廷命官惨死家中。叶平安曾为其治疗失眠顽疾,且正好出现在命案现场,因此被视作杀人凶手。元少城看出此案蹊跷,但仍将叶平安置于死地,以作自己晋阶的“投名状”。可任谁也想不到,叶平安早已在她的复仇之路上,下出了布局的第一颗棋。