一个糟少年无意中得到了灵力，一改以往形象成为翩翩少年郎，当他有勇气向心仪 的女孩表白的时候，却发现女孩是魁主的手下，他们要抓到身有异力少年在抓99个人来让魁主真正的复活，一场人与魁主之间的较量就此展开。
在第一季结尾中，Jaha自愿留在太空中，换来方舟部分人成功降落到地球上的好消息。但百子们却在成功引爆驻地打败地表人后，被抓到气象山的隔离区中……Bellamy和Finn也在与地表人的打斗中生死未卜。 而这一季的故事就从气象山、原方舟人和其他地球人种展开来。